La certificación es llevada a cabo por cuerpos certificadores acreditados por la Secretaria Internacional de FSC a través de su entidad denominada Accreditation Services International (ASI).

Tomando como referencia los estándares locales desarrollados por las iniciativas nacionales, los cuerpos certificadores evalúan las operaciones forestales de cada país y entregan el sello FSC el cual tiene una duración de cinco años. Las operaciones se revisan periódicamente.